O Curso de Mestrado em Microbiologia da UERJ (área de concentração em Bacteriologia Clínica) teve inicio em 1994. Em 2006 teve inicio o Doutorado e foi incorporada a área de concentração em Parasitologia.
O PPG-MICRO visa à formação de pessoal qualificado para as atividades de pesquisa e o exercício do magistério superior, bem como à capacitação técnica de pessoal de nível superior em diversos campos da área biomédica, incluindo Microbiologia Médica Aplicada, Microbiologia Celular, Imunologia Aplicada e Parasitologia Aplicada.
O PPG-MICRO tem, também, como meta a transferência de resultados para a sociedade no que diz respeito ao planejamento, execução e interpretação dos procedimentos laboratoriais para o diagnóstico microbiológico e/ou imunológico das infecções, estudo da virulência e das interações parasito-hospedeiro, estudo de marcadores epidemiológicos e de resistência a antimicrobianos de microrganismos de interesse médico, investigações de patógenos relacionados à infecção hospitalar, genética microbiana, avaliação do estado de imunidade de diferentes populações, estudo de imunogenicidade de vacinas e de mediadores inflamatórios, entre outros.
Seu público alvo são profissionais de diferentes áreas das Ciências da Saúde e Biológicas, como biólogos, biomédicos, médicos, odontólogos, farmacêuticos, enfermeiros, nutricionistas e veterinários.